鸿蒙文学网

手机浏览器扫描二维码访问

767锁定(第2页)

基于这一特点,10×GenomicsChromium平台同时测序数千个细胞。

与Smart-seq2等低通量方法相比,10×GenomicsChromium平台因其成本低、效率高而被更广泛地应用于B细胞检测。

在对多种scRNA-seq方法的比较研究中,10×Genomics也比其他高通量方法如Drop-seq和Indrops[33]具有更高的灵敏度,更高的与线粒体基因匹配的reads比例,更低的噪声。

利用10×Genomics和Smart-seq2平台,可以通过不同的免疫球蛋白重链特征区分CRC中B细胞的亚群,聚类结果无明显差异。

但是,10×Genomics也有不足之处,它不能覆盖所有的基因,并且存在3区域偏倚,在检测基因突变或mRNA剪接位点时可能会遗漏一些重要信息。

此外,这种方法对细胞质量有更高的要求,不同的组织和不同的获取样本的方法都不同。

利用scRNA-seq,我们可以更精确地定义细胞的亚型,追踪它们的发育谱系,确定克隆型和表现型之间的关系,绘制不同细胞之间的相互作用和空间关系图,从而从多个维度描述TME。

此外,还需要通过一系列体内和体外实验来验证结果。

我们总结了使用scRNA-seq研究的最新出版物

B细胞受体(Bcellreceptor,BCR)是一种能识别并结合特异性抗原的膜免疫球蛋白,在B细胞的分化成熟过程中起着重要作用。

BCR由两条重链和两条轻链组成,其中可变(V)、多样性(D)和连接(J)基因序列的重组创造了B细胞的多样性。

这种多基因的复杂性使得鉴别不同的受体变得困难。

然而,由于每个B细胞通常表达一个单一的受体,潜在的抗原特异性受体可以通过给定的原细胞链发现。

BCR的两个主要功能如下。

首先,它通过诱导B细胞激活过程中肌动蛋白骨架的实质改变和各种基因的表达来激活B细胞。

其次,它介导抗原的鉴定和提取,从而导致加工过的肽在主要组织相容性复合体II(MHCII)上呈现给T辅助细胞。

因此,BCR测序有助于进一步了解B细胞分化的轨迹及其特异性识别抗原性的机制,特别是当与单个B细胞的完整转录组身份配对时,这为了解癌症的发展提供了线索。

更重要的是,BCR测序可以追踪来自单细胞的群体,揭示克隆型和表型之间的关系。

ScRNA-seq技术在BCR测序中具有天然优势,因为含有UMI的微流控系统可以保证同源VH-VL配对的保存,而这些同源VH-VL配对在B细胞批量测序中可能会丢失。

BASIC是一个在单细胞分辨率上进行BCR测序的平台。

作为重建配对全长BCR序列的工具,BraCeR为B细胞的克隆推断和谱系追踪提供了一个完整的管道。

LIBRA-seq是一种高通量的方法,将BCRse-序列与其同源抗原特异性连接起来,可以用来绘制特定对象中数千个B细胞的抗原特异性。

研究免疫球蛋白以探讨体液免疫的复杂性

免疫球蛋白存在于肿瘤和血清中,在肿瘤中起双重作用。

抗体通过其片段可结晶(Fc)支配功能,并受翻译后修饰调控。

通常,免疫球蛋白是由骨髓和脾脏的浆细胞(PCs)分泌的。

组织炎症区域和肿瘤内部的pc,特别是在三级淋巴结构(TLS)中,分泌肿瘤相关抗体并直接在肿瘤上诱导原位效应。

在抗肿瘤功能方面,IgG是最重要的一类人免疫球蛋白,因为它能够结合巨噬细胞和自然杀伤细胞上的Fcγ受体,并促进、ADCP和CDC的作用。

此外,IgG对抗原处理和呈递至关重要,因为抗原呈递细胞(APCs)上的Fcγ受体可以与IgG包被的免疫复合物结合,激活T细胞。

抗体和抗体分泌细胞(APCs)的单细胞测序有助于进一步明确B细胞体液免疫的复杂网络。

已经报道了一种单细胞液滴微流控测序方案,用于特异性结合靶细胞的抗体,这也适用于初级人类是一种液滴微流体系统,用于高通量单细胞筛选分泌IgG的原代细胞,一方面,通过基于荧光的液滴内单细胞生物测定检测IgG活性,另一方面,用反转录对配对的V基因进行测序。

热门小说推荐
漫威至高火神

漫威至高火神

带着十二符咒的力量穿越到阿斯加德,成为奥丁的弟弟,为了不成为弟中弟,被自己侄女插死,被灭霸打响指弄死,威利迫不得已开始了一代火神之路,为了北方神的荣耀,焚漫威宇宙。奥丁弟弟太强怎么办,在线等索尔叔叔就比我弱一点点~ ̄▽ ̄~本站为书迷更新漫威至高火神最新章节,查看孤独浪狗所撰玄幻漫威至高火神的最新章节免费在线阅读。...

神卡

神卡

神卡由作者资产暴增创作全本作品该小说情节跌宕起伏扣人心弦是一本难得的情节与文笔俱佳的好书919言情小说免费提供神卡全文无弹窗的纯文字在线阅读。...

霸天雷神

霸天雷神

丛林深处,猛兽横行,又到了寒季虎崖堡猎户们储备食物的时节,一个少年在猎手中悄然崛起成为新秀神箭手,一切从阿爷手中的星蟒录开始...

修真狂龙混都市

修真狂龙混都市

作者蓝色天虎的经典小说修真狂龙混都市最新章节全文阅读服务本站更新及时无弹窗广告小说他,龙组龙王,想要平凡生活却不断被人骚扰。为朋友,他可以两肋插刀为亲人,他可以屠戮万千对敌人,就要斩草除根,尽显王者霸道!且看一代龙王,如何成长成为敌人的噩梦,各国元首的眼中钉肉中刺!!...

星河步兵

星河步兵

星际时代的步兵之王!~...

每日热搜小说推荐